<div>Sir,</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>This is not a gromacs developer question but I am desperate and you are the only one that can help me. I learning to use gromacs as part on my project and I ran the Ribonuclease s-peptide tutorial on the gromacs website (
<a href="http://www.gromacs.org">www.gromacs.org</a>).&nbsp;I modified the .mdp file so it runs for 1ns. When I check pressure using g_energy the average is 0.85bar but the RMSD is <strong>345bar</strong>. The .mdp file specifies 1bar and berendsen P-coupling. I don't know what I have done wrong. Any advice will be appreciated.
</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Thank you and kindest regards</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Michael</div>