<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<META content="MSHTML 6.00.6000.16608" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial size=2>hi,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV>Again a question about the replica exchange code. So we start in de do_md, 
<BR>energies are calculated in do_force and after this coordinates are 
updated.<BR>e.g.:<BR>step=0, energie at step0, update the coordinates<BR>So at 
the end of step 0 you have the energy of step 0 but the coordinates of 
<BR>step1.<BR>But when you come to the replica_exchange() (e.g., step=200) you 
pass the <BR>potential energy of step200 but the coordinates of step201, is this 
the case?&nbsp;Or what am I missing?</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>kind regards,</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>servaas&nbsp;<A 
href="mailto:gmx-developers@gromacs.org"></A></DIV></BODY></HTML>