<html><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><br><div><div>On Feb 5, 2009, at 3:35 AM, &lt;<a href="mailto:selarin@tmblog.ru">selarin@tmblog.ru</a>> &lt;<a href="mailto:selarin@tmblog.ru">selarin@tmblog.ru</a>> wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0; "><div class="hmmessage" style="font-size: 10pt; font-family: Verdana; ">Hello, everybody!<br><br>Is there version of Gromacs that use CUDA? CUDA is NVidia's architecture<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><br>for parallel data processing using NVidia's GPUs. Does it planned to<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><br>develop such version?<br></div></span></blockquote></div><br><div>Yes, but it is not yet ready for normal simulations.</div><div><br></div><div>You can search for "OpenMM" to find a specific version of Gromacs that can use GPU libraries for all-vs-all atom interactions, but obviously that only works for small systems.</div><div><br></div><div>Neighborlists is an interesting challenge that we're working on, but currently you want to stick to a CPU there - they will even be faster if you use multiple cores (not to mention that PME works...)</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div><br></div><div>Erik</div><div>&nbsp;</div></body></html>