Hi,<br><br>try to add to the gromacs configure:<br>CFLAGS=-I/PATH/TO/FFTW/include LDFLAGS=-L/PATH/TO/FFTW/libs<br><br>(this kind of questions should be sent to the user list not the dev list)<br><br>Roland<br><br><div class="gmail_quote">

On Wed, Jan 13, 2010 at 3:56 PM, Jin Wu <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:jiw2003@med.cornell.edu">jiw2003@med.cornell.edu</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">

<div style="font-family: &#39;Times New Roman&#39;; font-size: 16px;"><div class="im">Following your instruction, I started over installation as the following:<br>

cd ~/fftw-3.2.2<br>

./configure --enable-float --enable-sse --enable-shared<br>

make<br>

make install <br></div>

cd ~gromacs-4.0.7<div class="im"><br>

./configure --with-fft=fftw3 --without-x --enable-shared<br></div><div class="im">

error message:<br>

checking size of void*... configure: error: cannot compute sizeof (void*)<br>

See attached `config.log&#39; for more details<br>

<br>

Thank you for your help.</div></div>
<br>--<br>
gmx-developers mailing list<br>
<a href="mailto:gmx-developers@gromacs.org">gmx-developers@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-developers" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-developers</a><br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-developers-request@gromacs.org">gmx-developers-request@gromacs.org</a>.<br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>ORNL/UT Center for Molecular Biophysics <a href="http://cmb.ornl.gov">cmb.ornl.gov</a><br>

865-241-1537, ORNL PO BOX 2008 MS6309<br>