Hi,<div><br></div><div>we have a simulation in our group (Xiaohu&#39;s system) which shows much larger energy fluctuations (on a ~10ns time-scale) if compiled with 4.1.2. These fluctuation are large enough for the system to explode infrequently. The system behaves as expected (without the large fluctuations/explosions) when compiled with 4.4.4.</div>

<div><br></div><div>Roland<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Jun 24, 2010 at 11:05 AM, Berk Hess <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:hess@cbr.su.se">hess@cbr.su.se</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">

Hi,<br>
<br>
We just found out a that a bug that frequently showed up and we thought<br>
might be due to a bug in gcc 4.1<br>
was actually a bug in the GB sse2 (not sse3) code that only got<br>
triggered with gcc 4.1 with -O2 or -O3.<br>
<br>
So my question is now:<br>
Do you know of any issues with gcc 4.1.x on non-GB simulations?<br>
<br>
Thanks,<br>
<br>
Berk<br>
<font color="#888888"><br>
--<br>
gmx-developers mailing list<br>
<a href="mailto:gmx-developers@gromacs.org">gmx-developers@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-developers" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-developers</a><br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-developers-request@gromacs.org">gmx-developers-request@gromacs.org</a>.<br>
</font></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>ORNL/UT Center for Molecular Biophysics <a href="http://cmb.ornl.gov">cmb.ornl.gov</a><br>865-241-1537, ORNL PO BOX 2008 MS6309<br>
</div>