Hello,<div><br></div><div>I am implementing a modification on the non-bonded interactions kernel for a specific set of atomtypes. Everything works fine for a small system in vacuum, so I decided to solvate my system in water. The problem is that even if I defined a new water molecule (whole new .itp file) that uses new atomtypes, the kernel for SPC-SPC interactions is still being called. How do I prevent gromacs from using any of the kernels for optimised water?</div>


<div><br></div><div>Regards,</div><div><br></div><div>Leonardo Garma<br clear="all"><div><br></div>-- <br><div style="text-align:left"><span>Leonardo Garma</span></div><span><div style="text-align:left">Department of Biochemistry, University of Oulu, P.O.Box 3000,</div>


<div style="text-align:left">FI-90014 UNIVERSITY OF OULU, FINLAND</div><div style="text-align:left">Phone: <a value="+35885531139">+358 8 553 1139</a></div></span><br>
</div>