Elegant solution for what? You can postprocess a simulation trajectory that was written with a period you specify. If the information is needed while the simulation is running, you can just get it from the growing files. If some how you want the simulation to react, then you don&#39;t want to write data to file and read it again.<div>
<br></div><div>Mark<br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Jan 15, 2013 at 2:57 PM, santhosh <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:mesanthu@gmail.com" target="_blank">mesanthu@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
@Anton,<br>
<br>
You are right. The simulation is going to be mostly in 100&#39;s of ps and the<br>
space would not be a problem. Thanks.<br>
But I still think there should be much more elegant solution. I would look<br>
in the code and try figuring out a way, if not I would use this trick.<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
--<br>
View this message in context: <a href="http://gromacs.5086.n6.nabble.com/turn-on-pdb-output-after-every-step-tp5004551p5004584.html" target="_blank">http://gromacs.5086.n6.nabble.com/turn-on-pdb-output-after-every-step-tp5004551p5004584.html</a><br>

<div class="HOEnZb"><div class="h5">Sent from the GROMACS Developers Forum mailing list archive at Nabble.com.<br>
--<br>
gmx-developers mailing list<br>
<a href="mailto:gmx-developers@gromacs.org">gmx-developers@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-developers" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-developers</a><br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-developers-request@gromacs.org">gmx-developers-request@gromacs.org</a>.<br>
</div></div></blockquote></div><br></div>