<div dir="ltr">Hi,<div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Sat, Dec 21, 2013 at 1:31 AM, Mark Abraham <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:mark.j.abraham@gmail.com" target="_blank">mark.j.abraham@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Yes, we are dealing with that in <a href="https://gerrit.gromacs.org/2814" target="_blank">https://gerrit.gromacs.org/2814</a>. Thanks.</div>
<div><span style="color:rgb(80,0,80)"></span></div></div></blockquote><div><br></div><div>That only solves the issue in the master branch (where there is no Jenkins issue currently, because of differences between the branches). All the affected patches are in release-4-6.</div>
<div><br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><span style="color:rgb(80,0,80)">On Fri, Dec 20, 2013 at 9:14 PM, Carsten Kutzner </span><span dir="ltr" style="color:rgb(80,0,80)">&lt;<a href="mailto:ckutzne@gwdg.de" target="_blank">ckutzne@gwdg.de</a>&gt;</span><span style="color:rgb(80,0,80)"> wrote:</span><br>
</div></div><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div class="h5">

  

    
  
  <div text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">currently we have three patches in Gerrit where Jenkins votes &quot;-1&quot;
    due to an unrelated<br>
    warning <br>
    <br>
    <a href="http://jenkins.gromacs.org/job/Gromacs_Gerrit_4_6/4231/OPTIONS=Compiler=gcc%20CompilerVersion=4.8%20GMX_GPU=ON%20CUDA=5.5%20GMX_DOUBLE=OFF%20GMX_CPU_ACCELERATION=SSE2%20CMAKE_BUILD_TYPE=Release%20host=bs_nix1204,label=bs_nix1204/warnings16Result/source.48054/#889" target="_blank">nbnxn_cuda_data_mgmt.cu:899</a>,
    GNU Compiler 4 (gcc), Priority: Normal
    <p><b>unused parameter ‘fplog’ [-Wunused-parameter]</b></p></div></div></div></blockquote></div></div></blockquote><div>The problem is that for gcc 4.8, -Wno-unused-parameter (and various others) is only added to the C compilation flags, but nvcc gets its flags from the C++ flags. So these warnings are not silenced in CUDA code when compiling with gcc 4.8.</div>
<div><br></div><div>The reason why it has started occurring now is that previously, the gcc 4.8 build on the GPU host was built with GMX_GPU=OFF, but it has now been changed to build with CUDA 5.5. You can see this if you compare a successful build and a failing build for one of the affected patches.</div>
<div><br></div><div>Best regards,</div><div>Teemu</div></div></div></div>