<div dir="ltr"><div><div>Hello, all <br></div>I am trying to do some modification for minimize.c in gromacs 4.6.3.<br><br></div><div>  The problem is when I&#39;m doing the minimization, because of PBC,<br></div><div>particles will come through the wall and reenter from the other side!<br>
</div><div>  Instead of going through the wall and reenter from the other side, <br>I want to move the center of mass to keep the system inside the box.<br></div><div> In that case, I need to know what is the function for gromacs to <br>
move the particles between walls, so I could turn it down.<br><br></div><div> Thanks for any tips!<br></div><div>JhnegWei Li<br></div><div><br></div><div> <br></div></div>