<div dir="ltr">Not unless you mean the use of specbond.dat. Various old threads on gmx-users google knows about.<div><br></div><div>Mark</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Apr 17, 2014 at 5:05 PM, Sabine Reisser <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:sabine.reisser@kit.edu" target="_blank">sabine.reisser@kit.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hello,<br>
<br>
is there anything planned or even existing, to use pdb2gmx with cyclic peptides?<br>
<br>
Cheers<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
Sabine<br>
-- <br>
Gromacs Developers mailing list<br>
<br>
* Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/GMX-developers_List" target="_blank">http://www.gromacs.org/<u></u>Support/Mailing_Lists/GMX-<u></u>developers_List</a> before posting!<br>

<br>
* Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/<u></u>Support/Mailing_Lists</a><br>
<br>
* For (un)subscribe requests visit<br>
<a href="https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-developers" target="_blank">https://maillist.sys.kth.se/<u></u>mailman/listinfo/gromacs.org_<u></u>gmx-developers</a> or send a mail to <a href="mailto:gmx-developers-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-developers-request@<u></u>gromacs.org</a>.<br>

</font></span></blockquote></div><br></div>