<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:&#39;comic sans ms&#39;,sans-serif">Dear Gromacs User</div><div class="gmail_default" style="font-family:&#39;comic sans ms&#39;,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:&#39;comic sans ms&#39;,sans-serif">
I have ILs system in small box that is running on Amber 12 MD package. Now I want to use Gromacs MD package for my bigger system (Large no of molecules with proteins) with the same parameter. </div><div class="gmail_default" style="font-family:&#39;comic sans ms&#39;,sans-serif">
<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:&#39;comic sans ms&#39;,sans-serif">So, it is possible to convert Amber topology format to gromacs topology format. I have also prep and frcmod file for that molecules. which is use in tleap to generate topology file and Co-ordinate file to direct use in Amber MD package.</div>
<div class="gmail_default" style="font-family:&#39;comic sans ms&#39;,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:&#39;comic sans ms&#39;,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:&#39;comic sans ms&#39;,sans-serif">
Thank you in advace</div><div class="gmail_default" style="font-family:&#39;comic sans ms&#39;,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:&#39;comic sans ms&#39;,sans-serif">Sincerely </div><div class="gmail_default" style="font-family:&#39;comic sans ms&#39;,sans-serif">
Rahman</div><div class="gmail_default" style="font-family:&#39;comic sans ms&#39;,sans-serif"><br></div>
</div>