<div dir="ltr"><div>Are you trying to do several improper dihedrals? I don&#39;t think this is implemented. Type 9 is for several proper ones (for charmm force field).</div><div><br></div><div>Roland</div></div><div class="gmail_extra">

<br><br><div class="gmail_quote">On Tue, May 6, 2014 at 10:02 PM, Shirts, Michael R. (mrs5pt) <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:mrs5pt@eservices.virginia.edu" target="_blank">mrs5pt@eservices.virginia.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><br>
&quot;Type 9 allows multiple potential functions to be applied automatically to<br>
a single dihedral<br>
in the [ dihedral ] section when multiple parameters are defined for the<br>
same atomtypes in<br>
the [ dihedraltypes ] section.&quot;<br>
<br>
However, when I try this, grompp says:<br>
<br>
&quot;Overriding Proper Dih. parameters.<br>
  Use dihedraltype 4 to allow several multiplicity terms.<br>
<br>
  old: 0 1 3 0 1 3<br>
  new: HC     CT     CT     HC      9     0   5 4<br>
<br>
&quot;<br>
Should the code be checking for type 9, not type 4, since type 4 are<br>
explicitly improper dihedrals?<br>
<br>
Best,<br>
~~~~~~~~~~~~<br>
Michael Shirts<br>
Assistant Professor<br>
Department of Chemical Engineering<br>
University of Virginia<br>
<a href="mailto:michael.shirts@virginia.edu">michael.shirts@virginia.edu</a><br>
<a href="tel:%28434%29-243-1821" value="+14342431821">(434)-243-1821</a><br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
--<br>
Gromacs Developers mailing list<br>
<br>
* Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/GMX-developers_List" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/GMX-developers_List</a> before posting!<br>
<br>
* Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
<br>
* For (un)subscribe requests visit<br>
<a href="https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-developers" target="_blank">https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-developers</a> or send a mail to <a href="mailto:gmx-developers-request@gromacs.org">gmx-developers-request@gromacs.org</a>.</font></span></blockquote>

</div><br><br clear="all"><br>-- <br>ORNL/UT Center for Molecular Biophysics <a href="http://cmb.ornl.gov">cmb.ornl.gov</a><br>865-241-1537, ORNL PO BOX 2008 MS6309
</div>