<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=windows-1252"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    <div class="moz-cite-prefix">Hi,<br>
      <br>
      This looks like a case where the automation fails. I'll look into
      it.<br>
      <br>
      Berk<br>
      <br>
      On 06/30/2015 08:36 PM, Mark Abraham wrote:<br>
    </div>
    <blockquote
cite="mid:CAMNuMATB5dcBy-dmnriOdocAPJnyEEbQk3y7XWNxVBbQJV2eYw@mail.gmail.com"
      type="cite">
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;
        charset=windows-1252">
      <div dir="ltr">Hi,
        <div><br>
        </div>
        <div>An unexpected issue came up while running my automated
          tests of the RC tarball. Some newly-merged fatal errors that
          try to stop people using mdrun inefficiently sometimes cause
          the regressiontests to fail because they are defaulting to
          using too many threads. See <a moz-do-not-send="true"
            href="https://pastee.org/jgyae">https://pastee.org/jgyae</a></div>
        <div><br>
        </div>
        <div>We do have machinery in regressiontests to automatically
          re-try the test with fewer threads/cores/whatever, but only in
          response to a set of known mdrun error outputs, so we could
          add this particular error to that set.</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>But in this case, the note on line 43 suggests we should
          improve the code leading to the fatal error so that we aren't
          subsequently double-crossing ourselves. What do you think,
          Berk?</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>(This didn't come up in per-commit testing because we limit
          those to small numbers of cores because there's normally
          multiple testing instances running simultaneously on the same
          machine. We can probably do a better job of this after 5.1,
          with a bunch of new hardware available.)</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>Mark</div>
      </div>
      <br>
      <div class="gmail_quote">
        <div dir="ltr">On Tue, Jun 30, 2015 at 4:28 PM Mark Abraham &lt;<a
            moz-do-not-send="true"
            href="mailto:mark.j.abraham@gmail.com">mark.j.abraham@gmail.com</a>&gt;
          wrote:<br>
        </div>
        <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0
          .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
          <div dir="ltr">Hi,
            <div><br>
            </div>
            <div>I'll ship release candidate for 5.1 today, once I've
              sorted out release notes and put stuff on servers, etc.</div>
            <div><br>
            </div>
            <div>The last possible behaviour changing patch for 5.1 is <a
                moz-do-not-send="true"
                href="https://gerrit.gromacs.org/4753" target="_blank">https://gerrit.gromacs.org/4753</a>,
              if someone's inspired to make it work well. <a
                moz-do-not-send="true"
                href="https://gerrit.gromacs.org/4272" target="_blank">https://gerrit.gromacs.org/4272</a>
              is too late, even if someone's inspired to split off part
              of it.</div>
            <div><br>
            </div>
            <div>release-5-1 branch is active on git, gerrit and
              jenkins. Any remaining bug-fix patches on master branch in
              gerrit may be cherry-picked to release-5-1 branch (on
              gerrit or locally, as needed).</div>
            <div><br>
            </div>
            <div>Business will proceed as usual in release-5-1 - such
              branches are open only for all kinds of bug fixes,
              addition of docs, addition of tests, and in all cases
              aimed at stability and correctness.</div>
            <div><br>
            </div>
            <div>master branch is open for normal business, but people
              will probably be a bit quiet there for a while ;-)</div>
            <div><br>
            </div>
            <div>We are likely to issue a new 4.6.x some time soon, as
              we've had a number of mdrun issues fixed. (There's one
              known bug outstanding to fix, hopefully Michael has time
              real soon now.) Then release-4-6 branch will be
              permanently closed. We cannot maintain three active
              release branches and a development branch.</div>
            <div><br>
            </div>
            <div>We'll do a 5.0.x soon also, then change the policy for
              release-5-0 to "mdrun correctness bug fixes only" mode.</div>
            <div><br>
            </div>
            <div>Thanks to all for the hard work!</div>
          </div>
          <div dir="ltr">
            <div><br>
            </div>
            <div>Mark</div>
          </div>
        </blockquote>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>