<div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>regressiontests are fine for me with OpenCL. But if you are still testing release-5-1 code against master-branch regressiontests, that won&#39;t work, whether for OpenCL or not.</div><div><br></div><div>Mark</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Mon, Dec 7, 2015 at 10:17 PM Szilárd Páll &lt;<a href="mailto:pall.szilard@gmail.com">pall.szilard@gmail.com</a>&gt; wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Mon, Dec 7, 2015 at 12:15 PM, Szilárd Páll <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:pall.szilard@gmail.com" target="_blank">pall.szilard@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><span><div>On Fri, Dec 4, 2015 at 7:54 PM, Szilárd Páll <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:pall.szilard@gmail.com" target="_blank">pall.szilard@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br></div></span><div class="gmail_quote"><span><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><span><div><div>On Fri, Dec 4, 2015 at 7:26 PM, Vedran Miletić <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:rivanvx@gmail.com" target="_blank">rivanvx@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br></div></div></span><div class="gmail_quote"><span><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><span>2015-12-04 18:13 GMT+01:00 Szilárd Páll &lt;<a href="mailto:pall.szilard@gmail.com" target="_blank">pall.szilard@gmail.com</a>&gt;:<br>
&gt; Sounds good, is there anything on our side we can help with?<br>
&gt;<br>
&gt; Cheers,<br>
&gt;<br>
&gt; --<br>
&gt; Szilárd<br>
<br>
</span>Just making sure OpenCL works correctly with AMD and NVIDIA<br>
proprietary drivers is enough, so I can consider it a perfectly<br>
working black box.<br></blockquote><div><br></div></span><div>I hope that those cases are covered by our CI setup, but I better verify.</div></div></div></div></blockquote><div><br></div></span><div>Unfortunately we still don&#39;t have CI verification of OpenCL builds. There is a manual-trigger test project, but nothing gets tested automatically.</div></div></div></div></blockquote><div><br></div></div></div></div><div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><div>Additionally, some of the regressiontests don&#39;t even pass which is worrying. I&#39;ll get back to this later.</div></div></div></div><div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><div><br></div><div>I&#39;ll try to look into this, but I&#39;m very up-to-date with the state of the jenkins setup. </div><span><div><br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><span><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<br>
When I get GROMACS to run, I will require help with testing<br>
correctness and performance measurements.<br></blockquote><div><br></div></span><div>I can certainly help with that. If the regressiontests pass (make check) most likely everything is fine.</div><div>One more tip in case if you need it: for a quick correctness check I suggest running a few steps (&gt;0, e.g. 1-5) and diff-ing the energy terms printed in the log file (increase frequency using nstlog in the mdp) against a known to be correct mdrun. Slightly more elaborate is to, instead of diff-ing, use gmxcheck to check output (e.g. energy or force) against a reference output.</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div>--</div><div><div><div>Szilárd</div></div></div><span><div><br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div><div><br>
Regards,<br>
Vedran<br>
<br>
--<br>
Vedran Miletić<br>
<a href="http://vedranmileti.ch/" rel="noreferrer" target="_blank">http://vedranmileti.ch/</a><br>
--<br>
Gromacs Developers mailing list<br>
<br>
* Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/GMX-developers_List" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/GMX-developers_List</a> before posting!<br>
<br>
* Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
<br>
* For (un)subscribe requests visit<br>
<a href="https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-developers" rel="noreferrer" target="_blank">https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-developers</a> or send a mail to <a href="mailto:gmx-developers-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-developers-request@gromacs.org</a>.</div></div></blockquote></span></div><br></div></div>
</blockquote></span></div><br></div></div>
</blockquote></div></div></div>
--<br>
Gromacs Developers mailing list<br>
<br>
* Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/GMX-developers_List" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/GMX-developers_List</a> before posting!<br>
<br>
* Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
<br>
* For (un)subscribe requests visit<br>
<a href="https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-developers" rel="noreferrer" target="_blank">https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-developers</a> or send a mail to <a href="mailto:gmx-developers-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-developers-request@gromacs.org</a>.</blockquote></div>