<div dir="ltr">Hi,<br><div><br>since fa1360610d6fcf7eb263ce1181d9954074fd5151 &quot;Make thread affinity failures always end up in log&quot;, I get crashes in mdrun when using tMPI on any simulation I tried (does not affect OpenMPI). I am seeing this on two machines using Fedora 23 and 24, GCC 5.3 and 6, respectively.<br><br>Backtrace is <br><br>#0  0x00007ffff78c966f in tMPI_Thread_getspecific (key=...) at /home/miletivn/workspace/gromacs/src/external/thread_mpi/src/pthreads.c:571<br>#1  0x00007ffff78cff34 in tMPI_Reduce (sendbuf=0x7fffffffa4dc, recvbuf=0x7fffffffa4d8, count=1, datatype=0x7ffff7dd6660 &lt;tmpi_int&gt;, op=TMPI_LAND, root=0, comm=0x0) at /home/miletivn/workspace/gromacs/src/external/thread_mpi/src/reduce.c:247<br>#2  0x00007ffff63038a5 in invalidWithinSimulation (cr=0x681bd0, invalidLocally=false) at /home/miletivn/workspace/gromacs/src/gromacs/mdrunutility/threadaffinity.cpp:73<br>#3  0x00007ffff6303c0b in get_thread_affinity_layout (fplog=0x689410, cr=0x681bd0, hwinfo=0x680230, threads=8, pin_offset=0, pin_stride=0x7fffffffc634, localityOrder=0x7fffffffc638) at /home/miletivn/workspace/gromacs/src/gromacs/mdrunutility/threadaffinity.cpp:142<br>...<br><br></div><div>Variable key looks like<br><br>$1 = {initialized = {value = 0, padding = &#39;\000&#39; &lt;repeats 59 times&gt;}, key = 0x0}<br><br></div><div>So key is uninitialized. Any idea why?<br></div><div><br></div><div>Regards,<br></div><div>Vedran<br></div></div>