<p dir="ltr">That should not happen, although maybe there were such issues several years ago. Is this with unmodified code and a recent version (2016 or 5.2)? If so, please file an issue on redmine.gromacs.org and attach the grompp input&nbsp; to reproduce this.</p>
<p dir="ltr">Cheers,</p>
<p dir="ltr">Berk</p>