<div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>Please ask this kind of question on the gmx-users mailing list, since it relates to how to use the code, rather than how to develop the code :-)</div><div><br></div><div>Do be sure you&#39;ve read &quot;gmx help sasa&quot; and <a href="http://manual.gromacs.org/documentation/2016.3/user-guide/cmdline.html#g-sas">http://manual.gromacs.org/documentation/2016.3/user-guide/cmdline.html#g-sas</a> first :-)</div><div><br></div><div>Thanks,</div><div><br></div><div>Mark</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Mon, Mar 27, 2017 at 4:15 PM &lt;<a href="mailto:spss4@iacs.res.in">spss4@iacs.res.in</a>&gt; wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><u class="gmail_msg"></u>
<div style="font-family:Arial;font-size:14px" class="gmail_msg"><p class="gmail_msg">Hello,
</p><p class="gmail_msg">
        I am a new user of gromacs. I am trying to calculate SASA for a protein system. I have used the command</p>
<p class="gmail_msg">
        gmx sasa -f traj.trr -s md.tpr -o sasa.xvg -n index.ndx</p>
<p class="gmail_msg">
        From this I can only get the total SASA but I want hydrophobic and hydrophilic SASA separately. I know it can be done using g_sas command for older version. But I am using newer version of gromacs (gromacs-2016.1). Please help me to solve this problem. Thanks in advance.<br class="gmail_msg"><br class="gmail_msg">
        Sunipa Sarkar</p></div>
--<br class="gmail_msg">
Gromacs Developers mailing list<br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
* Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/GMX-developers_List" rel="noreferrer" class="gmail_msg" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/GMX-developers_List</a> before posting!<br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
* Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" rel="noreferrer" class="gmail_msg" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
* For (un)subscribe requests visit<br class="gmail_msg">
<a href="https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-developers" rel="noreferrer" class="gmail_msg" target="_blank">https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-developers</a> or send a mail to <a href="mailto:gmx-developers-request@gromacs.org" class="gmail_msg" target="_blank">gmx-developers-request@gromacs.org</a>.</blockquote></div>