<div dir="ltr">Dear Gromacs users,<div><br></div><div>I&#39;m trying to put two peptides inside the simulation box and have the ability to rotate them to face each other in a particular way before starting the simulation. I only know how to put them randomly in the simulation box.</div><div><br></div><div>My second question is how to put them in a certain distance from each other in the beginning as well.</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div>Armin</div></div>