<div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>This list is for discussing issues pertaining to GROMACS development, rather than usage. Please ask again on the gmx-users mailing list.</div><div><br></div><div>Mark<br><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Tue, Feb 13, 2018 at 12:42 AM Armin Solemanifar &lt;<a href="mailto:armin.solemanifar@gmail.com">armin.solemanifar@gmail.com</a>&gt; wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear Gromacs users,<div><br></div><div>I&#39;m trying to put two peptides inside the simulation box and have the ability to rotate them to face each other in a particular way before starting the simulation. I only know how to put them randomly in the simulation box.</div><div><br></div><div>My second question is how to put them in a certain distance from each other in the beginning as well.</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div>Armin</div></div>
--<br>
Gromacs Developers mailing list<br>
<br>
* Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/GMX-developers_List" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/GMX-developers_List</a> before posting!<br>
<br>
* Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
<br>
* For (un)subscribe requests visit<br>
<a href="https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-developers" rel="noreferrer" target="_blank">https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-developers</a> or send a mail to <a href="mailto:gmx-developers-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-developers-request@gromacs.org</a>.</blockquote></div></div></div>