<div dir="ltr">Hi <div><br></div><div>I am new to gromacs, and I need to calculate the Interaction Energy Matrix of a protein, which uses g_enemat command, but that requires for me to input .edr , .dat file.</div><div>Now I only have a pdb file to input, from that i can generate .gro file and I dont know how to generate .edr and .dat file.</div><div>Also I do not need to simulate any protein, it is just that I want the energy (LJ + coulombic) from the pdb file in form of IEM.</div><div><br></div><div><br></div><div>Can I know the step by step procedure to acheive that.</div><div><br></div><div>Thanks in Advance</div><div>Kanak</div></div>