

<HTML><BODY><p>Dear developers!</p><p>The existing realization of "gmx cluster" for calculations uses RMSD-matrix, <br>quadratically increasing with increase in length of a trajectory,<br>and already since 20000 frames calculation of clusters becomes impossible <br>because of requirements to memory and time.</p><p>Whether there are some special methods for a clustering of trajectories of big duration, <br>containing 100000 and more frames?</p><p>Best wishes<br>Boris Timofeev.</p><br><br></BODY></HTML>