<div dir="ltr"><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>Hi everyone,<div>  We are working on the next round of features for gmxapi, the high-level Gromacs API with Python bindings.  We have written a set of python scripts that demonstrate our planned functionality.  There are a few syntax issues being ironed out, but we thought this would be a good time to share them with the community.  If there are a) things that are obviously stupid, b) missing functionality that would be particularly important for a big fraction of the community, or c) things we&#39;re planning that you&#39;re super excited about, please let us know!</div><div><br></div><div>Code at:</div><div><a href="https://github.com/kassonlab/gmxapi-scripts" target="_blank">https://github.com/kassonlab/gmxapi-scripts</a><br></div><div><br></div><div>Disclaimer 1: These are primarily demonstration scripts, not design docs or user docs.</div><div><br></div><div>Disclaimer 2:  We are taking an incremental approach to API functionality.  We&#39;re trying to do a few things well and then expand the scope of things we do.  But we want those few things to cover as many use cases as we can...</div><div><br></div><div>Best,</div><div>--Peter Kasson</div><div><br></div><div><div><div dir="ltr" class="gmail-m_7562731658442928741gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div>----------------------------------------------------------------------<br>Peter Kasson, MD, PhD<br>Associate Professor<br>Departments of Molecular Physiology and Biological Physics<br>and of Biomedical Engineering<br>University of Virginia<br></div><div>and </div><div><span style="font-size:12.8px">Department of Cell and Molecular Biology, Uppsala University</span></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>