<div dir="ltr">Hi Rebecca,<div><br></div><div>I have to confess it was a _long_ time since I looked into these parts of the code, but you might be able to achieve this simply by defining a group, giving it the initial velocity you want, and then using the constant-acceleration functionality with the value 0.0 (since zero constant acceleration means constant speed).</div><div><br></div><div>And if that fails, it should be possible to fix it without too much effort :-)</div><div><br></div><div>Otherwise, the idea of the user groups is exactly that you should be able to quickly implement a small routine where you do something to an arbitrary group without having to redefine the input mdp options, create a new (incompatible) TPR version, and also having to modify the enum lists.</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div><br></div><div>Erik</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Fri, Apr 10, 2020 at 12:55 PM Rebecca Kleemann &lt;<a href="mailto:rkleeman@students.uni-mainz.de">rkleeman@students.uni-mainz.de</a>&gt; wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
  

    
  
  <div>
    <p>Hi, <br>
    </p>
    <p>I want to add a group to set atoms to a constant velocity.</p>
    <blockquote>
      <p><font size="-1" face="Courier New, Courier, monospace">enum<br>
          {<br>
              egcTC,    egcENER,   egcACC, egcFREEZE,<br>
              egcUser1, egcUser2,  egcVCM, egcCompressedX,<br>
              egcORFIT, egcQMMM,<br>
              egcNR<br>
          };</font></p>
      <p><font size="-1" face="Courier New, Courier, monospace">const
          char *gtypes[egcNR+1] = {<br>
              &quot;T-Coupling&quot;, &quot;Energy Mon.&quot;, &quot;Acceleration&quot;, &quot;Freeze&quot;,<br>
              &quot;User1&quot;, &quot;User2&quot;, &quot;VCM&quot;, &quot;Compressed X&quot;, &quot;Or. Res. Fit&quot;,
          &quot;QMMM&quot;, nullptr<br>
          };</font><br>
      </p>
    </blockquote>
    <p>Are &quot;User1&quot; and &quot;User2&quot; meant to be used like that and can they
      be renamed or should I add a new group and increase the number of
      groups?</p>
    <p>Greetings,</p>
    <p>Rebecca<br>
    </p>
  </div>

-- <br>
Gromacs Developers mailing list<br>
<br>
* Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/GMX-developers_List" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/GMX-developers_List</a> before posting!<br>
<br>
* Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
<br>
* For (un)subscribe requests visit<br>
<a href="https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-developers" rel="noreferrer" target="_blank">https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-developers</a> or send a mail to <a href="mailto:gmx-developers-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-developers-request@gromacs.org</a>.</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>Erik Lindahl &lt;<a href="mailto:erik.lindahl@dbb.su.se" target="_blank">erik.lindahl@dbb.su.se</a>&gt;</div><div>Professor of Biophysics, Dept. Biochemistry &amp; Biophysics, Stockholm University</div><div>Science for Life Laboratory, Box 1031, 17121 Solna, Sweden</div></div></div></div></div></div></div></div></div>