<P>Hi all, </P>
<P>Just a quick question. I am getting a feel of gromacs by playing around with helices in different solvents. My problem is that genbox re-writes the .gro file to represent the addition of solvent molecules, but doesn't re-write the .top file to reflect the changes. When I attempt to add the .itp file for example dmso.itp into the top file with the #include command it doesn't seem to register and i get an error back re not being able to define SD atom types. Could any one help, as I am sure that i am doing something fundamentally wrong.</P>
<P>Many thanks in advance </P>
<P>Chris</P><BR><BR><p><p><br><hr size=1><a href="http://uk.yahoo.com/mail/tagline_xtra/?http://uk.docs.yahoo.com/mail_storage.html"><b><font face="Arial" size="2">Get a bigger mailbox -- choose a size that fits your needs.</font></b></a><br><br><a href="http://uk.yahoo.com/mail/tagline_xtra/?http://uk.docs.yahoo.com/mail_storage.html"><font face="Arial" size="2">http://uk.docs.yahoo.com/mail_storage.html</font></a>