<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<META content="MSHTML 5.50.4522.1800" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><BR></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Hi people, 
<DIV><FONT face=Arial size=2>&nbsp;&nbsp;&nbsp; I'm a&nbsp;beginner at GROMACS 
and already have some douts:</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1 - How&nbsp;do I do to continue 
a calculation (minimization or dinamics) using the file generated in the last 
calculation&nbsp;?</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2 - Why sometimes happen that 
the algoritm cg simply stops the calculation whithout converging and also 
whithout giving&nbsp;the traditional message: "cg didn't converge after n steps 
?". &nbsp;Apparently, the calculation&nbsp;continues going on but the programe 
stops to write the results in the after_em file.</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3 - When steeepest descent give 
a value of Fmax = inf what do I do ? And why this happen ?</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Best whises,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Tanos Franca</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
</FONT></DIV></FONT></DIV></BODY></HTML>