<!doctype html public "-//w3c//dtd html 4.0 transitional//en">
<html>
Hi everybody,
<br>Does anybody why GROMOS96 lead to this error when I try to run cnvtop,
<br>where topology.g87 is a topology for GROMOS87 generated by <b>PRODRG</b>
<p><b>This is the script:</b>
<br>rm -f fort.*
<br>#---input units
<br>ln -s&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; topology.g87&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
fort.40&nbsp;&nbsp;&nbsp; # molecular topology
<p>#----output units
<br>ln -s&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; topology.g96&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
fort.20&nbsp;&nbsp;&nbsp; # final coordinates
<p>#---run the program
<br>/usr/local/gromos96/cnvtop.64
<p><b>and this is the result of cnvtop.64:</b>
<p>&nbsp;Scotty's CNVTOP Program!
<br>&nbsp;$Id: cnvtop.f,v 1.15 1996/10/10 16:43:15 wscott Exp $
<br>&nbsp;CNVTOP expects a binary GROMOS87 topology file on
<br>&nbsp;unit 40.
<br>&nbsp;It writes a GROMOS96 topology file to unit 20.
<br>&nbsp;ORDTOP: Error reading NRATT!
<p>Thanks in advance,
<br>Cheers
<br>Ruben
<br>&nbsp;
<pre>--&nbsp;
___________________________________________

Rubén Martínez-Buey. PhD student
Protein Function and Structure Dept. Lab. 352
Centro de Investigaciones Biológicas (CIB-CSIC)
C/ Velázquez, 144&nbsp; 28006&nbsp; MADRID
Tlf: +34-91-561 18 00 ext. 4380
___________________________________________</pre>
&nbsp;</html>