<!doctype html public "-//w3c//dtd html 4.0 transitional//en">
<html>
Hi Sergio,
<p>I suggest you to look at davapc1.bioch.dundee.ac.uk/programs/prodrg/gmx.pdf
<br>You can find there an excellent GROMACS Tutorial for Drug-Enzyme Complex
written by John E. Kerrigan
<br>Hope this help,
<br>cheers,
<br>Ruben
<br>&nbsp;
<p>Sergio Manzetti wrote:
<blockquote TYPE=CITE>Dear GMX users...after generating a topology of NADPH
from the PRODREG
<br>server, I wish to make the topology of the Portein-NADPH complex. The
<br>problem is that I don't know where to insert the topology of the NADPH
in
<br>the protein topology...is it independent of where I insert it?
<p>Sergio
<p>_______________________________________________
<br>gmx-users mailing list
<br>gmx-users@gromacs.org
<br><a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a>
<br>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the
<br>www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.</blockquote>

<pre>--&nbsp;
___________________________________________

Rub&eacute;n Mart&iacute;nez-Buey. PhD student
Protein Function and Structure Dept. Lab. 352
Centro de Investigaciones Biol&oacute;gicas (CIB-CSIC)
C/ Vel&aacute;zquez, 144&nbsp; 28006&nbsp; MADRID
Tlf: +34-91-561 18 00 ext. 4380
___________________________________________</pre>
&nbsp;</html>