<!doctype html public "-//w3c//dtd html 4.0 transitional//en">
<html>
Hi,
<br>you can try with WHATIF, you can build a protein from scratch with
it!
<p>cheers,
<br>Ruben
<br>&nbsp;
<p>Christoph Freudenberger wrote:
<blockquote TYPE=CITE>I heard that it is possible to mutate some amino
acids with the
<br>Swiss-PDBviewer. But is it also possible to create a
<br>protein or petide from scratch? Is it possible for
<br>other (non-biochem) molecules too?
<p>Xavier Periole wrote:
<br>> Rasmol is pretty good. But you cannot build the protein
<br>> I recewntly used Swiss-PDBviewer and I had absolutly
<br>> no problem when submiting the pdb to pdb2gmx.
<br>>
<br>> Xavier
<br>>
<br>> _______________________________________________
<br>> gmx-users mailing list
<br>> gmx-users@gromacs.org
<br>> <a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a>
<br>> Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the
<br>> www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.
<br>>
<p>--
<br>Christoph Freudenberger
<br>Abt. Organische Chemie I AK Siehl - Uni Ulm -Tel: ++49-731-502-2785
<p>_______________________________________________
<br>gmx-users mailing list
<br>gmx-users@gromacs.org
<br><a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a>
<br>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the
<br>www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.</blockquote>

<pre>--&nbsp;
___________________________________________

Rub&eacute;n Mart&iacute;nez-Buey. PhD student
Protein Function and Structure Dept. Lab. 352
Centro de Investigaciones Biol&oacute;gicas (CIB-CSIC)
C/ Vel&aacute;zquez, 144,&nbsp; 28006&nbsp; MADRID (SPAIN)
Tlf: +34-91-561 18 00 ext. 4380
Fax: +34-91-562 75 18</pre>
&nbsp;</html>