<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">
<HTML>
<HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=Windows-1252">
<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.0.6249.1">
<TITLE>traj.xtc</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<!-- Converted from text/plain format -->

<P><FONT SIZE=2>Dear GROMACS Users!<BR>
<BR>
&nbsp;&nbsp; I performed an MD run as follows:<BR>
<BR>
mdrun -s topol.tpr -x traj.xtc<BR>
<BR>
&nbsp;&nbsp; I received the promised output files but I did not recive the (optional) output traj.xtc that I would like to use as an input file for ngmx.<BR>
Isn't it enough for an traj.xtc output file if I simply indicate it on the<BR>
input/output list of mdrun? If not, where (before) should I make a change in<BR>
some files to prepare the proper environment in order to get traj.xtc from<BR>
mdrun?<BR>
<BR>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Thanks, Peter Nagy</FONT>
</P>

</BODY>
</HTML>