<!doctype html public "-//w3c//dtd html 4.0 transitional//en">
<html>

<blockquote TYPE=CITE>Dear Bert,</blockquote>
Thanks a lot four reply.
<blockquote TYPE=CITE>>
<br>> Average projection (mean):
<br>> eigenvec 1: -0.365220&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
0.457450
<br>> eigenvec 2:&nbsp;&nbsp; 0.137630&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
-0.169460
<br>> eigenvec 3:&nbsp;&nbsp; 0.137790&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
-0.319940
<br>> eigenvec 4:&nbsp;&nbsp; 0.068647&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
-0.078291
<br>> eigenvec 5:&nbsp;&nbsp; 0.087228&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
0.040858
<p>hmm, I suppose the two trajectories had a different length? Since
<br>otherwise the projections should be symmetrical with respect to zero.
<br>( ie -0.3&nbsp;&nbsp; 0.3 etc)</blockquote>
<font size=+1>They must be exactly symmetrical with respect to zero?</font>
<br><font size=+1>I mean -0.40976 and 0.41711 for example is right?</font><font size=+1></font>
<p><font size=+1>I&acute;ve generated 500 structures in each run with CONCOORD,
and then just merged them.</font>
<br><font size=+1>Thanks a lot again four your help</font>
<br><font size=+1>Regards,</font>
<br><font size=+1>Ruben</font>
<br>&nbsp;
<br>&nbsp;
<blockquote TYPE=CITE>&nbsp;
<p>Bert
<p>____________________________________________________________________________
<br>Dr. Bert de Groot
<p>Max Planck Institute for Biophysical Chemistry
<br>Theoretical molecular biophysics group
<br>Am Fassberg 11
<br>37077 Goettingen, Germany
<p>tel: +49-551-2011306, fax: +49-551-2011089
<p>email: bgroot@gwdg.de
<br><a href="http://www.mpibpc.gwdg.de/abteilungen/071/bgroot">http://www.mpibpc.gwdg.de/abteilungen/071/bgroot</a>
<br>____________________________________________________________________________
<p>_______________________________________________
<br>gmx-users mailing list
<br>gmx-users@gromacs.org
<br><a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a>
<br>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the
<br>www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.</blockquote>

<pre>--&nbsp;
___________________________________________

Rub&eacute;n Mart&iacute;nez-Buey. PhD student
Protein Function and Structure Dept. Lab. 352
Centro de Investigaciones Biol&oacute;gicas (CIB-CSIC)
C/ Vel&aacute;zquez, 144,&nbsp; 28006&nbsp; MADRID (SPAIN)
Tlf: +34-91-561 18 00 ext. 4380
Fax: +34-91-562 75 18</pre>
&nbsp;</html>