<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<META content="MSHTML 6.00.2723.2500" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV>1) Why the coordinates have been&nbsp;divided by 10&nbsp; from&nbsp;those 
data of spc216.pdb?</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial>in gromacs nanometers are used instead of the Angstrom 
</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial>10 A = 1nm</FONT></DIV>
<BLOCKQUOTE 
style="PADDING-RIGHT: 0px; PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #000000 2px solid; MARGIN-RIGHT: 0px">
  <DIV>
  <P>2) In the first row of spc216.gro, &nbsp;What are the meanings 
  of&nbsp;&nbsp;WATJP01, WFVG&nbsp;?</P></DIV></BLOCKQUOTE>
<P>WATJP01: ??? </P>
<P>WFVG&nbsp;: Wilfred Frederik Van Gusteren</P>
<BLOCKQUOTE 
style="PADDING-RIGHT: 0px; PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #000000 2px solid; MARGIN-RIGHT: 0px">
  <P>how to write this&nbsp;row?</P></BLOCKQUOTE>
<P><FONT face=Arial>by hand: it is just a reminder of the origin of the file and 
system I'd say</FONT></P>
<BLOCKQUOTE 
style="PADDING-RIGHT: 0px; PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #000000 2px solid; MARGIN-RIGHT: 0px">
  <P>3)&nbsp;In the last row of spc216.gro, what are the&nbsp;the meanings of 
  1.86206&nbsp; 1.86206 &nbsp;1.86206 ?</P></BLOCKQUOTE>
<P>those are the dimension of the box on X, Y and Z directions. In 
nanometers</P>
<P>&nbsp;</P>
<P><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</P>
<P><FONT face=Arial size=2>XAvier</FONT></P>
<P>&nbsp;</P></BODY></HTML>