<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD><TITLE></TITLE>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<META content="MSHTML 6.00.2723.2500" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Yop, sorry I meant 1000 K. 10000 K is way too much. 
</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Marco is right. With 11 residues it is unlikely 
that your peptide has a unique</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>conformation in solvent. It probably explore 
different conformations with diffenrent</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>probabilities. </FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>How did you generate your 10 structures with 
Modeler. I thought it needed a</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>template !! And what isthe point of doing an SA on 
a specific conformation ?</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>You loose it at 1000K anyway !! </FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>I did some thing similar where I generated 100 conf 
from SA with an implicit </FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>solvent (faster) and after that I 
made&nbsp;clusters of them. </FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>XAvier</FONT></DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV></BODY></HTML>