<DIV>Hi, Dear Anton,</DIV>
<DIV>Atoms exploded&nbsp;problem still remains,&nbsp; when I view &nbsp;.trr&nbsp; file by VMD, all atoms suddenly disappear.</DIV>
<DIV>I&nbsp; tried ngmx, it had error: &nbsp;float exception. </DIV>
<DIV>I tried trjconv -dump, it&nbsp;showed warning: "no output, trajectory ended at 3"&nbsp; </DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>could&nbsp;you&nbsp;give me more hints&nbsp;?&nbsp;&nbsp;&nbsp;</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>Thanks!<BR><BR><B><I>Anton Feenstra &lt;feenstra@chem.vu.nl&gt;</I></B> wrote:</DIV>
<BLOCKQUOTE class=replbq style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #1010ff 2px solid">Albert Sun wrote:<BR>&gt; Dear Anton<BR>&gt; I used VMD to view the .trr file, my problem was :<BR>&gt; I first loaded .gro fiel, it was OK to see the atoms clearly, then when I loaded the .trr file, all the picture of atoms disappeared immediately.<BR>&gt; <BR>&gt; What is the cauese?<BR><BR>Have you tried ngmx, or trjconv -dump ?<BR><BR>-- <BR>Groetjes,<BR><BR>Anton<BR>_____________ _______________________________________________________<BR>| | |<BR>| _ _ ___,| K. Anton Feenstra |<BR>| / \ / \'| | | Dept. of Pharmacochem. - Vrije Universiteit Amsterdam |<BR>|( | )| | | De Boelelaan 1083 - 1081 HV Amsterdam - Netherlands |<BR>| \_/ \_/ | | | Tel: +31 20 44 47608 - Fax: +31 20 44 47610 |<BR>| | Feenstra@chem.vu.nl - www.chem.vu.nl/~feenstra/ |<BR>| | "If You See Me Getting High, Knock Me Down" |<BR>| | (Red Hot Chili Peppers)
 |<BR>|_____________|_______________________________________________________|<BR><BR><BR>_______________________________________________<BR>gmx-users mailing list<BR>gmx-users@gromacs.org<BR>http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<BR>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <BR>www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.</BLOCKQUOTE><p><hr SIZE=1>
Do you Yahoo!?<br>
<a href="http://us.rd.yahoo.com/evt=10469/*http://sitebuilder.yahoo.com">Yahoo! SiteBuilder</a> - Free, easy-to-use web site design software