<DIV>Dear David and Users,</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>I read chapter 5 a few times on .top file, but still can not solve my problem after&nbsp;added in another type of atom C into the .top file, The error messabe: "Moleculetype Argon contains no atoms". <BR>my .top is as&nbsp;below :</DIV><FONT size=2>
<P>[defaults ]</P>
<P>; nb-function combinationrule</P>
<P>1&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;2</P>
<P>[ atomtypes ]</P>
<P>; type mass charge ptype sig eps</P>
<P>AR&nbsp; 12.011&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;0.0 &nbsp; &nbsp;A&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.23402E-02&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.33740E-05 </P>
<P>C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 12.011&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; A&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.23402E-02&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.33740E-05 </P>
<P>[ nonbond_params ]</P>
<P>; i&nbsp;&nbsp; j func&nbsp;&nbsp; c6&nbsp; &nbsp;c12</P>
<P>AR &nbsp;AR&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;0.22317e-02&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.74158E-06 </P>
<P>C&nbsp;&nbsp;&nbsp; C&nbsp;&nbsp; &nbsp;1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;0.22317e-02&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;0.74158E-06 </P>
<P>C&nbsp;&nbsp; AR&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;0.22317e-02&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.74158E-06 </P>
<P>[ pairtypes ]</P>
<P>; i &nbsp; j&nbsp; &nbsp;func&nbsp;&nbsp;&nbsp; c6&nbsp; &nbsp;c12</P>
<P>AR &nbsp;AR&nbsp; &nbsp;1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.22317e-02&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;0.74158E-06 </P>
<P>&nbsp;C&nbsp;&nbsp; &nbsp;C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;0.22317e-02&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;0.74158E-06 </P>
<P>C&nbsp;&nbsp; AR&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.22317e-02&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;0.74158E-06 </P>
<P>[ moleculetype ]</P>
<P>; molname nrexcl</P>
<P>Argon&nbsp; 1</P>
<P>Carbon 1</P>
<P>[ atoms ]</P>
<P>; id at type res nr residu name at name cg nr</P>
<P>1&nbsp; AR&nbsp; 1&nbsp; Argon&nbsp; AR 1 </P>
<P>2&nbsp; C &nbsp;1 &nbsp;Carbon &nbsp;C&nbsp; 1</P>
<P>[ system ]</P>
<P>; systemname</P>
<P>Argon&amp;Carbon</P>
<P>[ molecules ]</P>
<P>; molecule number</P>
<P>Argon 1000</P>
<P>Carbon 729</P>
<P></FONT>Would&nbsp;appreciate if you could tell me where is the&nbsp;problem?</P>
<P>Thanks&nbsp;in advance!</P>
<P>Albert</P>
<P>&nbsp;</P>
<DIV><BR></DIV><p><hr SIZE=1>
Do you Yahoo!?<br>
<a href="http://antispam.yahoo.com/whatsnewfree">Protect your identity with Yahoo! Mail AddressGuard</a>