<html>
<blockquote type=cite class=cite cite>I've tried running simulations
using my ligand-protein complex and <br>
initially with the drug-receptor tutorial from dr. kerrigan.<br>
However, each time I solvate the box, the create a box , its size is
<br>
huge:<br>
&nbsp;system size :103.000&nbsp; 3.861&nbsp; 4.761 
(nm)</blockquote><br>
So in the solvation step (genbox -cp -cs -p -o) the dimensions of the box
is changed?<br><br>
Catch ya,<br>
<x-sigsep><p></x-sigsep>
<b>Dr. Dallas Warren<br>
</b><i>Research Fellow<br>
</i>Department of Pharmaceutical Biology and Pharmacology<br>
Victorian College of Pharmacy, Monash University<br>
381 Royal Parade, Parkville VIC 3010<br>
<font color="#0000FF"><u>dallas.warren@vcp.monash.edu.au<br>
</u></font>+61 3 9903 9083<br>
<font face="Times New Roman, Times">--------------------------------------------------------------------------<br>
<i>When the only tool you own is a hammer, every problem begins to
resemble a nail.</font></i></html>