<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=big5">
<META content="MSHTML 6.00.2800.1400" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><SPAN class=514142803-17032004><FONT face=Arial color=#0000ff size=2>The 
heat capacity is proportional to&nbsp;the second moment (variance)&nbsp;of the 
energy.</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=514142803-17032004><FONT face=Arial color=#0000ff 
size=2>&lt;sigma(E)^2&gt; = k*T^2*Cv </FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=514142803-17032004><FONT face=Arial color=#0000ff 
size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=514142803-17032004><FONT face=Arial color=#0000ff 
size=2>Ilya</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=514142803-17032004><FONT face=Arial color=#0000ff 
size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<BLOCKQUOTE dir=ltr style="MARGIN-RIGHT: 0px">
  <DIV class=OutlookMessageHeader dir=ltr align=left><FONT face=Tahoma 
  size=2>-----Original Message-----<BR><B>From:</B> gmx-users-admin@gromacs.org 
  [mailto:gmx-users-admin@gromacs.org]<B>On Behalf Of </B>Jia-Lin 
  Lo<BR><B>Sent:</B> Tuesday, March 16, 2004 6:59 PM<BR><B>To:</B> 
  gmx-users@gromacs.org<BR><B>Subject:</B> [gmx-users] Calculate heat 
  capacity<BR><BR></FONT></DIV>
  <DIV><FONT size=2>Hi, </FONT></DIV>
  <DIV><FONT size=2>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; I am doing a simple simulation ( 
  protein in water). When I use </FONT></DIV>
  <DIV><FONT size=2>g_energy to monitor the&nbsp; energy change, there are 
  several statistical values</FONT></DIV>
  <DIV><FONT size=2>printed on screen. I notice the last line is the heat 
  capacity value. I would</FONT></DIV>
  <DIV><FONT size=2>like to know how does it to be calculated?&nbsp; Is there 
  any formula for it ?</FONT></DIV>
  <DIV><FONT size=2>I want to write a program to calculate it by myself.&nbsp; 
  </FONT></DIV>
  <DIV><FONT size=2>Thanks for your help in advance.</FONT></DIV>
  <DIV><FONT size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
  <DIV><FONT size=2>Jialin LO</FONT></DIV></BLOCKQUOTE></BODY></HTML>