<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=gb2312">
<META content="MSHTML 6.00.2800.1106" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY>
<DIV><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><SPAN 
class=843304806-24032004>Calculate volume of your system box. Standard 
concentration of Na+&amp; Cl- is around 143 mOsmole/liter. With this 
concentration, calculate no. of ions for your water box. Then use command genion 
to add those many atoms to your system.</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><SPAN 
class=843304806-24032004></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><SPAN 
class=843304806-24032004></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<BLOCKQUOTE dir=ltr style="MARGIN-RIGHT: 0px">
  <DIV class=OutlookMessageHeader dir=ltr align=left><FONT face=Tahoma 
  size=2>-----Original Message-----<BR><B>From:</B> gmx-users-admin@gromacs.org 
  [mailto:gmx-users-admin@gromacs.org]<B>On Behalf Of 
  </B>Yinghong<BR><B>Sent:</B> Tuesday, March 23, 2004 10:57 PM<BR><B>To:</B> 
  gmx-users@gromacs.org<BR><B>Subject:</B> [gmx-users] How to calculate the 
  number of salt ions?<BR><BR></FONT></DIV>
  <P>Hi, all:</P>
  <P>To make the simulation under a more natural environment, maybe, some NaCl 
  molecules are needed to add into water solvent.</P>
  <P>My question is whether this step is necessary? and how many Na and Cl ion 
  pairs should be added?</P>
  <P>This problem is probably a little silly, but I do wanna know about the 
  answer!</P>
  <P>Your help will be greatly appreciated!</P>
  <P>&nbsp;</P>
  <P>Regards</P>
  <P>Xie YH</P>
  <P>&nbsp;</P></BLOCKQUOTE></BODY></HTML>