<P>
hi all,<BR>
I have certain queries to ask<BR>
<BR>
I have completed md on a protein for ns.<BR>
<BR>
1.I want pdb files at say at every 25 ps interval with bfactors attached in the pdb files as u see in crystallographically solved structure.<BR>
<BR>
2.Actually I want to see variation in B-factors for the atoms during the period of simulation,like rmsd with respect to time.<BR>
 <BR>
BY using trjconv i got pdbfiles at desired time intervals,but bfactor variation how to get it,is there a option.<BR>
 <BR>
thanls for any suggestion.cheers -smith <BR>
<BR>
<BR>

</P>
<br><br>
<A target="_blank" HREF="http://clients.rediff.com/signature/track_sig.asp"><IMG SRC="http://ads.rediff.com/RealMedia/ads/adstream_nx.cgi/www.rediffmail.com/inbox.htm@Bottom" BORDER=0 VSPACE=0 HSPACE=0></a>