<P>
&nbsp; <BR>
Hello gromacs users<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  I am simulating a protein with ATP.To run pdb2gmx command i need to modify the atomnames of atp and add hydrogens as per the ffgmx.itp ( i am using forcefield-0 of gromacs-3.1.1).After using 'editconf' and 'genbox'commands If i run grompp command to genarate xxx.tpr file it is complaining that diherdral angles are not properly set for ATP.Kindly suggest me a solution for this problem.Your help is deeply appreciated.<BR>
<BR>
Thanking you<BR>
<BR>
prasad.
</P>
<br><br>
<A target="_blank" HREF="http://clients.rediff.com/signature/track_sig.asp"><IMG SRC="http://ads.rediff.com/RealMedia/ads/adstream_nx.cgi/www.rediffmail.com/inbox.htm@Bottom" BORDER=0 VSPACE=0 HSPACE=0></a>