<P>
&nbsp; <BR>
<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp;  Hello gromacs usres,<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; To simulate my protein with ATP i am using force field no:2 of gromacs version 3.1.1. When i tried to analyse hydrogen bonds between protein and ATP , program complaining that there are no donors and acceptors in a group &quot;ATP&quot; . Kindly let me know how and where to define acceptors and donors in ATP. I changed atom names of ATP present in&nbsp; ffG---.rtp file. <BR>
<BR>
Many thanks in advance<BR>
<BR>
prasad reddy. 
</P>
<br><br>
<A target="_blank" HREF="http://clients.rediff.com/signature/track_sig.asp"><IMG SRC="http://ads.rediff.com/RealMedia/ads/adstream_nx.cgi/www.rediffmail.com/inbox.htm@Bottom" BORDER=0 VSPACE=0 HSPACE=0></a>