<P>
&nbsp; <BR>
<BR>
&nbsp; Dear gromacs users<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  To do energy minimization for more time i increased n_steps in steep.mdp file to 1000 from 100.Then i tried to get xxx.tpr for SD by 'grompp' command but gromacs complaining that the number of coordinates in xxx.pdb ( input file i used for 'grompp' command) and xxx.top file are diffrent. But if try with steep.mdp having n_steps 100, grompp working properly with out any problem. Kindly mail me the solution for this problem. Your help is deeply appreciated.<BR>
<BR>
Many thanks in advance<BR>
<BR>
<BR>
prasad.
</P>
<br><br>
<A target="_blank" HREF="http://clients.rediff.com/signature/track_sig.asp"><IMG SRC="http://ads.rediff.com/RealMedia/ads/adstream_nx.cgi/www.rediffmail.com/inbox.htm@Bottom" BORDER=0 VSPACE=0 HSPACE=0></a>