<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-2">
<META content="MSHTML 6.00.2900.2523" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial size=2>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><SPAN lang=EN-US><FONT 
size=3><FONT face="Times New Roman">Dear all.<?xml:namespace prefix = o ns = 
"urn:schemas-microsoft-com:office:office" /><o:p></o:p></FONT></FONT></SPAN></P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><SPAN lang=EN-US><FONT 
face="Times New Roman" size=3>I&#8217;m new with gromacs.<SPAN 
style="mso-spacerun: yes">&nbsp; </SPAN>I plan to simulate kappa opioid receptor 
model in </FONT></SPAN></P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><SPAN lang=EN-US><FONT 
face="Times New Roman" size=3>a lipid membrane.<SPAN 
style="mso-spacerun: yes">&nbsp; </SPAN>I prepared all the necessary input 
files.<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp; </SPAN>Eventually 
during</FONT></SPAN></P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><SPAN lang=EN-US><FONT 
face="Times New Roman" size=3>EM I get some strange results, and it goes only 
for 15 -20</FONT></SPAN></P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><SPAN lang=EN-US><FONT 
face="Times New Roman" size=3>steps.<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp; 
</SPAN>If anyone has mdp example file for the protein-membrane system 
</FONT></SPAN></P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><SPAN lang=EN-US><FONT 
size=3><FONT face="Times New Roman">EM and MD please send me one.<SPAN 
style="mso-spacerun: yes">&nbsp; </SPAN>Thank you in advance. <SPAN 
style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;</SPAN><SPAN 
style="mso-spacerun: yes">&nbsp;</SPAN><SPAN 
style="mso-spacerun: yes">&nbsp;</SPAN><SPAN 
style="mso-spacerun: yes">&nbsp;</SPAN></FONT></FONT></SPAN></P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><SPAN lang=EN-US><FONT 
size=3><FONT face="Times New Roman">(128DPPC membrane <SPAN 
style="mso-spacerun: yes">&nbsp;</SPAN>with GPCR) 
<o:p></o:p></FONT></FONT></SPAN></P></FONT></DIV></BODY></HTML>