<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-2" http-equiv="Content-Type">
  <title></title>
</head>
<body bgcolor="#ffffff" dir="ltr" text="#000000">
<p>Try using those files as a template, good work.<br>
<br>
Michal Kolinski wrote:<br>
</p>
<blockquote cite="mid001501c4cd8d$7d05ee40$be01000a@hades" type="cite">
  <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; ">
  <meta content="MSHTML 6.00.2900.2523" name="GENERATOR">
  <style></style>
  <div><font face="Arial" size="2">
  <p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0pt;"><span lang="EN-US"><font
 size="3"><font face="Times New Roman">Dear all.<o:p></o:p></font></font></span></p>
  <p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0pt;"><span lang="EN-US"><font
 face="Times New Roman" size="3">I&#8217;m new with gromacs.<span style="">  </span>I
plan to simulate kappa opioid receptor model in </font></span></p>
  <p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0pt;"><span lang="EN-US"><font
 face="Times New Roman" size="3">a lipid membrane.<span style="">  </span>I
prepared all the necessary input files.<span style="">   </span>Eventually
during</font></span></p>
  <p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0pt;"><span lang="EN-US"><font
 face="Times New Roman" size="3">EM I get some strange results, and it
goes only for 15 -20</font></span></p>
  <p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0pt;"><span lang="EN-US"><font
 face="Times New Roman" size="3">steps.<span style="">  </span>If
anyone has mdp example file for the protein-membrane system </font></span></p>
  <p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0pt;"><span lang="EN-US"><font
 size="3"><font face="Times New Roman">EM and MD please send me one.<span
 style="">  </span>Thank you in advance. <span style="">  </span><span
 style=""> </span><span style=""> </span><span style=""> </span></font></font></span></p>
  <p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0pt;"><span lang="EN-US"><font
 size="3"><font face="Times New Roman">(128DPPC membrane <span style=""> </span>with
GPCR) <o:p></o:p></font></font></span></p>
  </font></div>
  <pre wrap="">
<hr size="4" width="90%">
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</blockquote>
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