<DIV>thanks. on a related matter, what is the difference between -fit and -pfit?<BR><BR><B><I>David &lt;spoel@xray.bmc.uu.se&gt;</I></B> wrote:
<BLOCKQUOTE class=replbq style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #1010ff 2px solid">On Sun, 2004-11-28 at 19:58 +0000, Abil Aliev wrote:<BR>&gt; i was wondering if somebody could clarify the rot option of trjconv:<BR>&gt; does this remove both the overall and internal torsional motions or<BR>&gt; only the overall rotation. <BR>only overall.<BR><BR>&gt; <BR>&gt; <BR>&gt; <BR>&gt; <BR>&gt; <BR>&gt; ______________________________________________________________________<BR>&gt; Win a castle for NYE with your mates and Yahoo! Messenger <BR>&gt; _______________________________________________<BR>&gt; gmx-users mailing list<BR>&gt; gmx-users@gromacs.org<BR>&gt; http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<BR>&gt; Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <BR>&gt; www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<BR>-- <BR>David.<BR>________________________________________________________________________<BR>David van der Spoel, PhD, Assoc.
 Prof., Molecular Biophysics group,<BR>Dept. of Cell and Molecular Biology, Uppsala University.<BR>Husargatan 3, Box 596, 75124 Uppsala, Sweden<BR>phone: 46 18 471 4205 fax: 46 18 511 755<BR>spoel@xray.bmc.uu.se spoel@gromacs.org http://xray.bmc.uu.se/~spoel<BR>++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++<BR><BR>_______________________________________________<BR>gmx-users mailing list<BR>gmx-users@gromacs.org<BR>http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<BR>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <BR>www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<BR></BLOCKQUOTE></DIV><p>
                <hr size=1><font size="2" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><a href="http://uk.rd.yahoo.com/evt=28672/*http://www.yahoo.co.uk/popularity"><strong><font face="Arial, Helvetica, sans-serif">Win a castle</font></strong></a><font face="Arial, Helvetica, sans-serif"><strong> 
 for NYE with your mates and Yahoo! Messenger</strong></font><strong><font color="#FF9900"> 
</font></strong></font>