<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">

<html>

<head>

  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">

  <title></title>

</head>

<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">

is there any way of detecting this or similar type of option

incompatibilities by grompp? pbc=full with constraints on passes with

no warning.<br>

<br>

David wrote:

<blockquote cite="mid1102624819.6033.5.camel@h19n2fls34o1123.telia.com"

 type="cite">

  <pre wrap="">On Thu, 2004-12-09 at 20:20 +0000, Abil Aliev wrote:

  </pre>

  <blockquote type="cite">

    <pre wrap="">often i get error message about some unsettled water

atom when using pbc=full. if this is changed to xyz,

things proceed smoothly. once i changed constraints to

hbonds from all-bonds keeping pbc full. this also

helped. But pbc=full with constraints=all-bonds is not

reliable and md may fail even after ~2ns of run. i

gather pbc=full is a relatively new option and has not

been tested fully compared to pbc=xyz?? 

    </pre>

  </blockquote>

<pre wrap="">pbc=full can not be used with constraints.

  </pre>

  <blockquote type="cite">

    <pre wrap="">

___________________________________________________________ 

ALL-NEW Yahoo! Messenger - all new features - even more fun! <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://uk.messenger.yahoo.com">http://uk.messenger.yahoo.com</a>

_______________________________________________

gmx-users mailing list

<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a>

<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a>

Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the 

www interface or send it to <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.

    </pre>

  </blockquote>

</blockquote>

<br>

</body>

</html>