<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <title></title>
</head>
<body>
hello David,<br>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; I want my values in the range of 180 to -180 or 0
to 360.So how can i achieve that?? U have said that "periodicity is
taken out" ..So how can i &nbsp;reinclude that.<br>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Thank you,<br>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Alok Jain<br>
<br>
David wrote:<br>
<blockquote type="cite"
 cite="mid1102970113.4993.4.camel@h19n2fls34o1123.telia.com">
  <pre wrap="">On Tue, 2004-12-14 at 00:32 +0530, Alok wrote:
  </pre>
  <blockquote type="cite">
    <pre wrap="">Hello Gmx Usrs,
                          I am  calculating the Dihedral angle (chi1 
&amp;chi 2)for a residue in my protein using the program g_angle. I was 
thinking that dihedral angle should be in the range -180 to +180  or 0 
to 360 degree . But i am getting values which are mixed up of these two 
range  like -185 degree or sometimes negative and positive   values both 
... can any one suggest me where is the problem? if i am doing anything 
wrong.

i used  g_angle     -f    ***.xtc   -s    ***.tpr   -n    ***.ndx     
-od    -ov   -type dihedral   command.
                                            
    </pre>
  </blockquote>
  <pre wrap=""><!---->check what they look like as a function of time. it may be that the
periodicity is taken out, in which case they should be continuous.


  </pre>
  <blockquote type="cite">
    <pre wrap="">                            
                                                                        
          thanks in advance
                                                                        
                                                                        
                 Alok Jain

_______________________________________________
gmx-users mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a>
Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the 
www interface or send it to <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.
    </pre>
  </blockquote>
</blockquote>
</body>
</html>