<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=Windows-1252">
<TITLE>Message</TITLE>

<META content="MSHTML 6.00.2800.1400" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY text=#000000 bgColor=#ffffff>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial color=#0000ff size=2>Hi 
all</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial color=#0000ff 
size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial color=#0000ff size=2>i am 
facing&nbsp;a problem which was posted on the mailing list almost a year back: 
</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial color=#0000ff 
size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><FONT 
color=#000000>&gt; [gmx-users] g_mindist<BR>&gt; Fri Dec 12 14:12:01 CET 2003 
</FONT></FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><FONT 
color=#000000>&gt; Dear all,</FONT></FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><FONT 
color=#000000>&gt; When I try to count the number of contacts of two groups, the 
output<BR>&gt; file numcont.xvg always shows 0 even when i set the distance is 
4nm<BR>&gt; which is the same as my box. Why? What's the 
problem?</FONT></FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><FONT 
color=#000000>&gt; Xiaoyi</FONT></FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial 
size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial size=2>in addition i dont 
think the option " -o&nbsp;&nbsp; atm-pair.out " is working correctly. 
</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial 
size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial size=2>could not find any 
helpful postings .. </FONT></SPAN><SPAN class=407421813-06012005><FONT 
face=Arial size=2>any updates on this would be helpful .. </FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial 
size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial size=2>am using&nbsp;<SPAN 
class=407421813-06012005><FONT face=Arial 
size=2>&nbsp;</FONT></SPAN></FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=407421813-06012005><FONT face=Arial size=2>:-)&nbsp; VERSION 3.2.1&nbsp; 
(-:<BR></DIV></FONT></SPAN></FONT></SPAN>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial 
size=2>thnx</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial size=2>sandeep 
</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial size=2>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV align=left>
<DIV align=left><SPAN class=441544308-20082004><FONT face=Arial color=#0000ff 
size=2>---</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=441544308-20082004><FONT face=Arial color=#0000ff 
size=2>Research Associate</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=441544308-20082004><FONT face=Arial color=#0000ff 
size=2>Computational Biology Group</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=441544308-20082004><FONT face=Arial><FONT color=#0000ff><FONT 
size=2>Bioinformatics Institute<SPAN 
class=097225009-20082004>&nbsp;</SPAN></FONT></FONT></FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=441544308-20082004><FONT face=Arial><FONT color=#0000ff><FONT 
size=2><SPAN 
class=097225009-20082004>Singapore</SPAN></FONT></FONT></FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=441544308-20082004><FONT face=Arial><FONT color=#0000ff><FONT 
size=2><SPAN 
class=097225009-20082004></SPAN></FONT></FONT></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV>
<DIV><SPAN class=441544308-20082004><FONT face=Arial><FONT color=#0000ff><FONT 
size=2><SPAN 
class=097225009-20082004></SPAN></FONT></FONT></FONT></SPAN></DIV><SPAN 
class=441544308-20082004><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><A 
href="http://www.bii.a-star.edu.sg/~ssomani">http://www.bii.a-star.edu.sg/~ssomani</A></FONT></SPAN></DIV></DIV></FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial 
size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial size=2><FONT 
color=#0000ff></FONT>&nbsp;</DIV></FONT></SPAN>
<DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT face=Arial 
size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV><SPAN class=407421813-06012005><FONT 
color=#0000ff>
<DIV><FONT face=Arial><FONT size=2><SPAN 
class=407421813-06012005>&nbsp;</SPAN></FONT></FONT></DIV></FONT></SPAN></BODY></HTML>
<BR>

<P><FONT SIZE=2>---<BR>
Outgoing mail is certified Virus Free.<BR>
Checked by AVG anti-virus system (http://www.grisoft.com).<BR>
Version: 6.0.822 / Virus Database: 560 - Release Date: 12/22/2004<BR>
</FONT> </P>