<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;charset=ISO-8859-1">
  <title></title>
</head>
<body text="#000000" bgcolor="#ffffff">
Hello,<br>
<br>
The T-Coupling groups are defined in your .mdp file (tc-grps).<br>
Apparently, the groups you defined are non-unique.<br>
<br>
Ran.<br>
<br>
vema aparna wrote:<br>
<blockquote type="cite"
 cite="mid20050106100924.26409.qmail@webmail28.rediffmail.com">
  <p>&nbsp; <br>
Dear Users,<br>
  <br>
I am doing a MD simulation of a protein. I was not able to generate
.tpr files using grompp as I got an error message stating <br>
  <br>
  <br>
Fatal error: Atom 2015 in multiple T-Coupling groups (14 and 2)<br>
  <br>
When i checked the atom numbers in the protein, i found atom number
2015 to be the last atom of the ligand. Where do i get the information
about T-coupling groups. Can someone help me out to fix this error and
proceed with the MD simulation.<br>
  <br>
Thank you,<br>
  <br>
Aparna<br>
  </p>
Vema Aparna
  <br>
Prof. G.&nbsp;R. Desiraju's&nbsp;Group,
  <br>
School of&nbsp;Chemistry
  <br>
University of&nbsp;Hyderabad
  <br>
Hyderabad -&nbsp;500 046
  <br>
INDIA<br>
  <br>
  <a target="_blank"
 href="http://clients.rediff.com/signature/track_sig.asp"><img
 src="http://ads.rediff.com/RealMedia/ads/adstream_nx.cgi/www.rediffmail.com/inbox.htm@Bottom"
 border="0" vspace="0" hspace="0" moz-do-not-send="true"></a> <br>
+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++<br>
This Mail Was Scanned By Mail-seCure System<br>
at the Tel-Aviv University CC.<br>
  <pre wrap="">
<hr width="90%" size="4">
_______________________________________________
gmx-users mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a>
Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the 
www interface or send it to <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.</pre>
</blockquote>
<br>
<pre class="moz-signature" cols="72">-- 
------------------------------------------------------
Ran Friedman
Laser Laboratory for Fast Reactions in Biology
Department of Biochemistry
Faculty of Life Sciences
Tel-Aviv University
Tel. +972-3-6409824
Fax. +972-3-6409875
------------------------------------------------------
</pre>
</body>
</html>