<P>
&nbsp; <BR>
Hi!<BR>
<BR>
I just want to run the MD run of a protein without deleting the crystallographic water. When i go for MD run with positional restraint, I see an error message during preprocessing the minimised protein using grompp as:<BR>
<BR>
Fatal error:Atom 2015 in multple T-coupling groups(14 and 2)<BR>
<BR>
Where the atom 2015 corresponds to the last atom of the ligand. <BR>
<BR>
Can anyone suggest me how can I fix this error.<BR>
<BR>
Thanking you,<BR>
<BR>
Aparna<BR>
<BR>
<BR>
&nbsp; &nbsp; <BR>

</P>


Vema Aparna <br>
Prof. G.&nbsp;R. Desiraju's&nbsp;Group, <br>
School of&nbsp;Chemistry <br>
University of&nbsp;Hyderabad <br>
Hyderabad -&nbsp;500 046 <br>
INDIA<br><br>
<A target="_blank" HREF="http://clients.rediff.com/signature/track_sig.asp"><IMG SRC="http://ads.rediff.com/RealMedia/ads/adstream_nx.cgi/www.rediffmail.com/inbox.htm@Bottom" BORDER=0 VSPACE=0 HSPACE=0></a>