<html>
<blockquote type=cite class=cite cite>Probably genion placed solvent
inside the protein, and you used genion without the -random option. In
that case it places the ion where the potential is most favorable, which
will usually be inside the protein.</blockquote><br>
Has that been fixed?&nbsp; I haven't tried to use the option for awhile
now, as last time I did that was broken and it simply placed all ions
along one face of the box.<br><br>
Catch ya,<br>
<x-sigsep><p></x-sigsep>
<b>Dr. Dallas Warren<br>
</b><i>Lecturer<br>
</i>Department of Pharmaceutical Biology and Pharmacology<br>
Victorian College of Pharmacy, Monash University<br>
381 Royal Parade, Parkville VIC 3010<br>
<font color="#0000FF"><u>dallas.warren@vcp.monash.edu.au<br>
</u></font>+61 3 9903 9083<br>
<font face="Times New Roman, Times">--------------------------------------------------------------------------<br>
<i>When the only tool you own is a hammer, every problem begins to
resemble a nail.</font></i></html>